以下是B类院校中制药工程专业的综合推荐，综合多个权威来源整理如下：

一、全国重点院校

天津大学

天津医科大学（药学部）和天津工业大学（制药工程）均位列全国制药工程专业前三，其中天津医科大学在药学领域实力突出。

四川大学

四川大学制药工程专业为国家级特色专业，科研实力和临床应用能力均处于国内领先水平。

中国药科大学

南京医科大学（药学部）下属的中国药科大学，是药学领域权威学府，制药工程专业排名全国前三。

北京化工大学

在2023-2024年多个排名中位列前三，以化工与制药工程结合为特色。

二、其他知名院校

华东理工大学 ：2023年排名第一，以工程与药学交叉学科见长。

南京工业大学 ：多次进入制药工程专业前十，工科背景与药学结合紧密。

哈尔滨工业大学 ：在B类院校中表现突出，科研项目丰富。

西安交通大学 ：医学与工科结合，制药工程领域有重要研究。

三、B类院校补充推荐

浙江大学 ：综合实力强，制药工程与临床结合紧密。

中南大学 ：医学类高校，制药工程与临床医学协同发展。

西南医科大学 ：以临床药学为特色，制药工程与医疗资源整合良好。

四、选择建议

考研方向 ：若以学术研究为优先，可关注北京中医药大学、天津医科大学等老牌院校；若倾向实践应用，四川大学、四川化工大学等院校更具优势。

地区特色 ：江苏、山东、河南等地高校数量较多，可根据地理位置和职业规划选择。

以上推荐综合了学科排名、专业实力、录取分数线及区域特色，供参考。建议结合自身兴趣和职业规划进一步筛选。