南京的冷门考研专业包括以下几个：

石油化工专业 ：由于工作性质较为艰苦以及行业需求有限，这个专业相对较冷。

审计会计专业 ：工作性质和就业前景不如一些热门专业，因此也较为冷门。

动物科学专业 ：虽然相对冷门，但就业前景相当好，社会需求量大，就业率高达100%。

思想政治教育专业 ：近年来逐渐变热，受到国家政策导向的影响，就业率和考研率都较高。

哲学类专业 ：报考人数较少，竞争较小，但就业面较窄。

汉语国际教育专业 ：国家线相对较低，招生人数较多，就业方向广泛。

考古人类学、民俗学、宗教学 ：这些专业竞争相对较小，但需对领域有浓厚兴趣。

对外汉语专业 ：课时少，不辛苦，人少竞争少，奖学金机会多。

微生物学 ：虽然报考热度有所上涨，但整体来说还是相对冷门的专业。

兽医学 ：学科实力不错，但开设院校较少，总的来说学科实力比南农强的院校也比较少。

工商管理 ：报考人数相对较少，成功报考的概率较高。

设计学 ：同样报考人数较少。

外国语言文学 ：报考人数相对较少。

中国史 ：报考人数相对较少。

力学 ：报考人数相对较少。

水利工程 ：报考人数相对较少。

这些专业虽然报考人数较少，但各有其特点和优势。建议考生根据自己的兴趣和职业规划，选择适合自己的专业进行报考。