厅机关由27个处室和单位组成:15个行政处室(厅办公室、厅规科处、厅政法处、厅水资源处、厅财务处、厅人事处、厅建设处、省湖泊局、厅水保处、厅农水处、厅安监处、省防办、机关党办、水利工会、离退处),7个参公处室和单位(省堤防局、厅农电处、厅外办、水政监察总队、省饮水办、厅质监中心、厅水保中心)，5个事业单位(厅经济办、厅后勤中心、厅宣传中心、省抢险总队、厅预算中心)。

 厅直预算单位中有5个水库管理单位(湖北省高关水库管理局、湖北省吴岭水库管理局、湖北省漳河工程管理局、湖北省富水水库管理局、湖北省王英水库管理局)，3个大型泵站管理单位(湖北省田关水利工程管理处、湖北省樊口电排站管理处、湖北省金口电排站管理处)，2个国家级重要分蓄洪工程管理单位(湖北省荆江分蓄洪区工程管理局、湖北省洪湖分蓄洪区工程管理局)，4个堤防工程管理单位(湖北省河道堤防管理局、荆州市长江河道管理局、湖北省汉江河道管理局、荆门市汉江河道堤防管理处)(管理长江堤防852公里、汉江堤防767公里)，1个水文单位(湖北省水文水资源局)，1所院校(湖北水利水电职业技术学院)，1个科研单位(湖北省水利水电科学研究院)。省水利厅机关和二级单位详细情况见下表: 序 号 单位名称 1 湖北省水利厅机关 2 湖北水利水电职业技术学院 3 湖北省水文水资源局 4 湖北省水利水电科学研究院 5 荆州市长江河道管理局 6 湖北省汉江河道管理局 7 湖北省荆江分蓄洪区工程管理局 8 湖北省洪湖分蓄洪区工程管理局 9 荆门市汉江河道堤防管理处 10 湖北省高关水库管理局 11 湖北省吴岭水库管理局 12 湖北省田关水利工程管理处 13 湖北省樊口电排站管理处 14 湖北省金口电排站管理处 15 湖北省漳河工程管理局 16 湖北省富水水库管理局 17 湖北省王英水库管理局 18 湖北省河道堤防管理局