整理哲学考研笔记的方法如下：

熟悉教材和参考书 ：

在复习专业课时，首先要熟悉《一本通》或其他参考书籍，不需要全文背过，而是要分析每一段材料是针对什么问题，从什么角度进行论述的，然后把全文读熟。

结合课本和上课笔记 ：

在熟悉了《一本通》之后，再结合课本和上课时做的笔记，整理出自己的知识体系。这有助于将不同来源的信息整合在一起，形成一个系统的复习框架。

使用记号笔 ：

在《一本通》上用记号笔画框架，这样可以更清晰地看到知识点的结构和逻辑关系。先看框架部分，尝试记忆框架内容，这有助于形成对知识体系的初步认识。

整理关键词组成的思路链条 ：

通过整理关键词组成的思路链条来帮助记忆和答题。例如，对于王夫之的宇宙论这一知识点，可以整理出“气一元论（太虚一实）+理气关系+道器关系+天地之化日新”等关键词链条。

整理框架法 ：

先根据目录了解整本书的整体架构，做一个大致的思维导图。然后再看书，接着把看过的章节根据先前的导图列出来，最后再进一步细化。这种方法有助于从宏观上把握书籍的结构，再逐步深入到具体内容。

一口气笔记法 ：

可以尝试在一周的前三天把设定好要完成的内容一口气看完，在书上勾画和整理好，剩下几天一口气做笔记。这种方法可以提高笔记的效率，因为是在对文本有一定熟悉程度的基础上进行的。

归纳总结法 ：

将教材中的内容用自己的话归纳总结，整理重要知识点，用自己的逻辑进行整理，便于背诵和复习。

留白和补充 ：

看第一遍书时留白，标注不懂的地方。第二遍看书时开始做笔记，包括章节、知识点和要点。第三遍将书读薄，形成精炼的笔记。

区分重点和非重点 ：

在做笔记时，用不同颜色的记号笔区分难点、非难点、易错点和常考点，便于后续复习和记忆。

定期复习 ：

整理好笔记后，要定期复习，巩固记忆。可以采用不同的复习方法，如总结、复述、做练习题等，以检验自己的掌握情况。

通过以上步骤，可以有效地整理哲学考研的笔记，形成清晰的知识体系，从而提高复习效率，取得更好的成绩。