选择日本考研学校时，可以从以下几个方面进行综合考虑：

研究兴趣和方向 ：

确定自己的研究兴趣和方向，然后调查和比较不同大学在该领域的研究水平和成就，选择最适合自己的研究领域和机构。

课程设置和教学方法 ：

考虑不同大学的课程设置和教学方法，选择适合自己学习方法的大学或机构。例如，有些大学课程注重实验和研究，而有些则注重人文和社会科学领域的研究。

教授和内诺制度 ：

日本的研究生申请是“教授内诺制”，因此选择与申请方向相匹配的教授至关重要。了解每所学校的教授及其研究方向，选择与自己研究课题相关的教授。

学校排名和综合实力 ：

虽然排名不能作为唯一参考标准，但排名可以帮助了解院校的大致层次。建议选择几个有录取条件差别的院校，以防止同时落选。

奖学金和资金支持 ：

考虑到日本生活的高昂成本，选择提供奖学金或资金支持的大学或机构，以减轻经济压力。

地理位置和气候 ：

学校所在城市对留学生来说是一个重要参考因素，包括交通便利性、气候适宜度和经济发达程度等。

学术特点 ：

了解不同大学的学术特点，例如某些大学在特定领域有独特的优势或研究成果，选择与自己的学术兴趣相符的学校。

入学要求和申请流程 ：

详细了解目标院校的入学要求，包括语言成绩、专业背景、申请截止日期、研究计划书要求等，并确保符合这些要求。

留学生比例和入试 ：

考虑留学生的比例和是否有单独的留学生入试，这些因素可能影响申请的成功率和难度。

学费和生活费 ：

根据自己的经济情况，选择学费和生活费合适的院校，特别是私立院校之间在学费和生活费上差异较大。

学校类型 ：

根据自己的实际情况选择国立大学、公立大学或私立大学。

出身校或自身实力 ：

根据自己的出身校或学术背景选择合适的学校。

通过以上几个方面的综合考虑，可以更全面地评估和选择适合自己的日本考研学校。建议多收集信息，咨询已经在读或毕业的学长学姐，以便做出更明智的决策。