以下是化学系最好的大学排名：

北京大学

北京大学化学学科是国家一级重点学科和“国家理科基础科学研究和教学人才培养基地”，在历次教育部全国高校一级学科评估中均名列榜首，在全球高校化学院（系）的相关学科评估与排名中位列15名左右。

清华大学

清华大学化学系始建于1926年，在新中国成立时，已成为国内高校中师资力量较为雄厚、学术水平较高的化学系之一。化学系下设无机化学、有机化学、分析化学、物理化学、高分子化学与物理五个研究所。

中国科学技术大学

中国科学技术大学化学与材料科学学院由化学物理系、应用化学系、化学系、材料科学与工程系、高分子科学与工程系和化学实验教学中心六个单位组成。化学学科为国家一级重点学科，在第四次教育部全国高校一级学科评估中获评A+。

复旦大学

复旦大学化学系在科研和教学方面都有很高的水平，化学专业也是一级学科国家重点学科。

南京大学

南京大学化学学科在科研和人才培养方面表现突出，也是国家一级重点学科。

浙江大学

浙江大学化学学科在科研和教学成果方面都有显著成绩，也是国家一级重点学科。

南开大学

南开大学化学系历史悠久，科研实力雄厚，是化学专业的重要高校。

北京化工大学

北京化工大学是教育部直属的全国重点大学，化学专业在国内有很高的声誉。

天津大学化学系

天津大学化学系在科研和教学方面都有很高的水平，也是国内知名的化学专业高校。

哈尔滨工业大学化学系

哈尔滨工业大学化学系在工程、生物医学等领域的研究深具国际影响力。

这些大学在化学领域都有很高的学术水平和研究实力，建议根据个人兴趣和职业规划，选择合适的学校进行深造。