根据搜索结果，果树专业在农业院校中具有较高声誉和实力的学校主要集中在以下几类，供参考：

一、国家重点学科与顶尖院校

中国农业大学

国家重点学科，农学与生物技术学院下属果树学专业实力强劲，覆盖作物学、植物保护学、园艺学等多学科领域。

西北农林科技大学

位于杨凌，农业教育重镇，果树学专业在葡萄、苹果等方向具有突出优势，拥有国家级研究中心和实验室。

南京农业大学

南方果树学重要基地，涵盖蔬菜、果树、花卉等多方向研究，2022年园艺学学科评估为A等级。

二、区域特色鲜明院校

浙江大学 ：农业与生物技术学院包含果树科学研究所，科研实力突出。

华中农业大学 ：南方果树学核心区，国家级研究中心和实验室配置完善。

山东农业大学 ：北方果树学优势明显，园艺系在北方地区具有较高影响力。

湖南农业大学 ：2022年园艺学评估为B+等级，南方果树研究特色鲜明。

三、其他推荐院校

沈阳农业大学 ：第四轮园艺学评估中表现优异。

河北农业大学 ：北方老牌农林院校，实验设备丰富。

上海交通大学 ：以植物遗传育种和园艺生物技术为特色。

四、选择建议

明确研究方向 ：如葡萄种植优先考虑西北农林科技大学，南方果树研究可选浙江大学或南京农业大学。

结合地理位置 ：北方考生可关注山东、河北；南方考生宜选浙江、华中地区院校。

参考学科评估 ：A等级院校综合实力更强，但竞争也更激烈。

建议考生结合自身兴趣、职业规划及地理位置，综合评估后选择院校。考研时需关注各校招生简章及专业目录，部分院校对果树品种或研究方向有明确要求。