空军工程大学的专业设置以航空特色为核心，涵盖工学、军事学两大学科门类，具体专业如下：

一、工学类核心专业

飞行器动力工程

主要学习飞机飞行原理、航空发动机原理及航空装备维护技术，培养航空机械装备维修与指挥人才。

机械工程

覆盖航空无损检测、装备维修等方向，强调机械设计与航空发动机控制。

电气工程及其自动化

包含航空特设、计量技术与指挥等方向，培养电气系统维护与自动化控制人才。

电子信息工程

侧重航空电子对抗、电磁频谱工程等，为通信与导航系统提供技术支持。

导航工程

主要研究航空导航技术，培养导航系统设计与维护人员。

武器系统与工程

覆盖航空军械、武器发射与维护，培养国防科技领域专业技术人才。

二、其他特色专业

雷达工程 ：航空雷达技术研发与维护

测控技术与仪器 ：高精度测量与仪器仪表应用

自动化 ：工业自动化与智能控制

信息工程 ：信息处理与通信系统设计

火力指挥与控制工程 ：航空火控系统设计与指挥

航空管制与领航工程 ：航空交通管理与导航技术

三、新增专业

2024年新增 电子信息工程（电磁频谱工程） 专业，属于通信类招生方向。

四、学科门类与地位

学校是全军唯一拥有海湾、海军唯一拥有机场的院校，学科门类涵盖工学、军事学，是军队五所综合性大学之一。

以上专业均围绕空军现代化需求设置，录取时按分数优先原则在军校提前批次投档。