根据多个权威来源的综合信息，中国制药工程领域实力较强的大学主要集中在以下几所，其制药专业在国家级评价中表现突出：

一、全国顶尖高校

中国药科大学（南京）

中国最早的药科高等学府，制药工程专业为国家级一流本科专业，连续多年位居全国榜首。

优势领域：生物制药，拥有国家级“卓越工程师教育培养计划”实施项目。

四川大学（成都）

国家级特色专业，制药工程排名全国第二，以临床药学和药物制剂见长。

理由：综合实力强，科研项目丰富，学生实践机会多。

天津大学（天津）

制药工程专业排名全国第三，以化工与制药工程结合为特色。

优势：实验设备先进，行业合作紧密。

二、其他高水平院校

华东理工大学（上海） ：生物制药领域突出，与医药企业合作广泛。

武汉大学 ：生物制药专业获A+评价，科研实力居国内前列。

东南大学 ：在生物制药和药物研发方面表现优异。

华中科技大学 ：部分排名中，以药理学和临床医学结合为特色。

三、其他值得关注的院校

北京化工大学 ：在精细化工与制药工程领域有重要研究。

浙江大学 ：生物制药专业注重实践，录取门槛较高。

沈阳药科大学 ：在中药现代化和药物分析方面有突出贡献。

总结

若以综合实力和国家级评价为标准， 中国药科大学、四川大学、天津大学 的制药专业最强。若侧重生物制药方向， 中国药科大学 居首；若关注临床应用与实践， 四川大学和天津大学 更具优势。建议考生结合自身分数和职业规划选择院校。