冷门理科化学专业主要包括以下几种：

应用化学 ：这是一个理论化学专业，更关注最基本的科学原理，通常被认为是理科专业。

分析化学 ：涉及物质的分离、鉴定和测量分析，虽然它在科学研究和实验室工作中起着重要作用，但相对于其他化学领域，可能不太引人注目。

核化学 ：研究核反应、核能利用和核材料等领域，由于涉及到核能和辐射方面的问题，这个领域相对较为特殊和专业化，因此可以认为是冷门专业之一。

药物化学 ：研究药物的合成、结构活性关系等，在医药领域虽然重要，但在公众意识中的知名度相对较低。

化学工程与工艺 ：这个专业主要在工厂生产线上工作，工作环境艰苦，工作量大，时间长，因此被认为是冷门专业。

环境工程 ：应用数学、物理学、化学等基础科学的原理，结合生产实践所积累的技术经验而发展起来的学科，可能因为就业前景、工作环境和薪资待遇等因素，导致报考人数较少。

采矿工程 ：与矿业加工工程类似，通常与艰苦的体力劳动相关联，因此较为冷门。

造纸专业 ：工作环境通常高温、有异味，并且可能存在健康风险，如听力损伤和神经伤害，因此较为冷门。

水务工程专业 ：涉及水处理和供应，可能因为工作环境和内容相对专业而冷门。

这些专业可能因为它们的研究内容、工作环境或是与公众日常生活距离较远等原因而被认为是冷门。建议学生在选择专业时，充分考虑自己的兴趣、职业规划以及各个专业的实际情况，做出明智的选择。