二本导弹专业主要包括以下几种：

飞行器设计与工程 ：涉及飞行器的设计、制造和工程应用，包括导弹的设计与制造。

飞行器动力工程 ：专注于飞行器动力系统的设计、研究和开发，适用于导弹等飞行器的动力系统设计。

武器系统与工程 ：研究武器系统的设计、开发和应用，包括导弹武器系统的设计与实施。

弹药工程与爆炸技术 ：涉及弹药的设计、制造和爆炸技术，与导弹的弹药部分密切相关。

探测制导与控制技术 ：专注于导弹的探测、制导和控制系统的设计与实现。

电子科学与技术 ：涉及导弹的电子设备和系统的设计与开发，包括导航、制导和控制等电子系统。

通信工程 ：研究导弹通信系统的设计与实现，确保导弹在飞行过程中的通信畅通。

信息对抗技术 ：涉及导弹防御系统的信息对抗技术，包括雷达干扰、抗干扰措施等。

导弹工程 ：这个专业综合性强，涵盖了导弹设计、制造、测试和部署等各个方面。

制导雷达工程 ：专注于导弹的制导雷达系统的设计与实现。

计算机工程 ：涉及导弹系统的计算机辅助设计、仿真和测试。

指挥工程 ：研究导弹部队的指挥、控制和战术，包括作战指挥、任务规划等。

空间工程 ：涉及空间任务的规划、卫星的设计与应用，与导弹技术有一定的关联。

核工程与核技术 ：虽然这个专业与导弹技术有一定的关联，但它主要研究核能与核技术，如核反应堆、核材料等。

这些专业在二本高校中都有开设，具体选择哪个专业还需根据个人兴趣和职业规划来决定。建议查阅各个高校的招生简章和专业介绍，以获取更详细的信息。