复旦大学和哈尔滨工程大学都是中国的知名高等学府，它们在大数据领域都有一定的实力和声誉。哪所学校更好，取决于你的个人兴趣、职业规划以及对学校资源和环境的需求。

从专业排名来看，根据2024年1月11日高顿网校发布的数据科学考研院校排名，复旦大学的该专业为B+，哈尔滨工程大学的该专业为B。

从学校综合实力来看，复旦大学是一所综合性的全国重点大学，以其在文、社、理、工、医等多个领域的卓越表现而闻名。哈尔滨工程大学则是一所具有鲜明工科特色的高水平大学，尤其在船舶与海洋工程、核科学与技术等领域具有较强的实力。

从专业课程设置来看，复旦大学的大数据专业可能更注重数据科学的理论和方法，以及与其他学科的交叉融合。哈尔滨工程大学的大数据专业可能更侧重于数据管理和应用，以及与工程和技术领域的结合。

从就业前景来看，复旦大学的毕业生在金融、互联网、咨询等行业都有较高的竞争力。哈尔滨工程大学的毕业生则在国防、军工、船舶等领域有一定的优势。

从师资力量来看，复旦大学大数据学院有中国科学院院士2人、知名学者8人、青年教师14人，还依托复旦大学大数据研究院双聘部分校内相关领域顶尖学者参与学院的教学科研工作。哈尔滨工程大学的教师队伍中，院士名单就达到了6人，其他国家级科研创新人才更是数不胜数。

从教学设施来看，复旦大学拥有全国最先进的图书馆、实验室和体育设施，为学生提供了优越的学习和生活环境。哈尔滨工程大学的教学设施也比较完善，学校先后入选“211工程”，“ 双一流”建设高校名单，共有一级博士点15个，一级硕士点32个，国家重点学科2个，科研项目2个。

总之，如果你对数据科学的理论和方法感兴趣，并且希望在金融、互联网、咨询等行业发展，那么复旦大学可能是一个更好的选择。如果你对数据管理和应用感兴趣，并且希望在工程和技术领域发展，那么哈尔滨工程大学可能是一个更好的选择。