在余杭区的大学中，以下几所可以被认为是最好的：

浙江大学 ：简称“浙大”，是中国最早创办的新式高等学校之一，也是国内顶尖的综合性大学之一。浙江大学在多个排名中均位居前列，是中国乃至世界知名的高等学府。

浙江工业大学 ：简称“浙工大”，是浙江省人民政府与教育部共建的省属重点大学，国家“2011计划”首批牵头高校之一，拥有较高的学术水平和研究实力。

浙江理工大学 ：是一所以工为主，工、理、文、经、管、法、艺术等多学科协调发展的省属重点建设大学，办学历史可追溯到1897年，具有深厚的学术底蕴。

杭州电子科技大学 ：简称“杭电”，是浙江省人民政府与国防科技工业局共建的教学研究型大学，参与了多项国家级科研项目，科研经费充足，学术实力较强。

杭州师范大学 ：是浙江省重点建设高校，以师范教育为传统，文理并重，人文学科与自然学科协调发展，是一所综合性大学。

浙江交通职业技术学院 ：创建于1958年，隶属于浙江省交通运输厅，素有“浙江交通人才摇篮”的美誉，是浙江省首批高职院校之一。

浙江传媒学院 ：是一所以传媒教育为主的全日制普通高等学校，被誉为“中国广播电视及新媒体人才摇篮”。

浙江科技学院 ：是一所以工为主，工、理、文、经、管、法、艺术等多学科协调发展的应用型大学。

浙江外国语学院 ：以外国语言文学为主体，多学科协调发展的本科高校。

浙江中医药大学 ：以中医药为主，多学科协调发展的本科高校。

浙江工商大学 ：以经济学、管理学为主，多学科协调发展的本科高校。

浙江大学东方学院 ：地址位于振兴中路。

杭州师范大学钱江学院 ：拥有优良的教学传统和现代化的教学设施，致力于培养高素质的教师和社会各领域的专业人才。

浙江水利水电学院 ：在水利水电领域具有很高的声誉，拥有先进的实验室和研究设施。

这些学校各有特色和优势，具体选择哪所学校还需根据个人兴趣和职业规划来决定。建议访问各大学的官方网站或联系学校招生办公室获取最新信息。