学校饭堂存在的问题主要包括以下几个方面：

食材质量参差不齐 ：有些学校食堂为了降低成本，采购的食材往往质量不佳，甚至出现过期肉类等问题，严重威胁学生的饮食健康。

价格虚高，分量不足 ：同一种食物在不同地方的售价差距很大，同一份食物在不同的时间段内也可能出现价格上的差异，而且很多学生反映食堂的餐量不如从前。

管理混乱 ：食堂档口管理不规范，可能存在利益输送，学生数量可能被虚报，导致预期收入不准确。

卫生问题 ：存在使用过期食材、三无食材等卫生问题，甚至可能因卫生问题而发生高额罚款。

菜品质量不一 ：菜品种类虽多，但制作质量参差不齐，有的食品可能不符合健康饮食标准。

合同陷阱 ：某些食堂合同可能包含对商户不利的条款，如长期未结算的营业款、高额的保证金和进场费等。

位置选择 ：食堂位置离学生用餐地点过远可能影响生意。

季节性影响 ：食堂可能在年初进行整改，影响商户的正常经营。

证照问题 ：办理证照过程复杂，特别是食品流通许可证，可能延迟开业。

供应链问题 ：食材供应可能不稳定，影响食堂的正常运营。

竞争激烈，利润低 ：市场大，刚需大，各类餐饮企业涌入，竞争激烈，学校食堂虽然具有价格相对便宜、卫生有保障的优势，但利润较低。

资金压力 ：部分学校会收取档口营业额，结算周期可能较长，增加资金压力。

员工和管理问题 ：员工问题可能导致经营困难，管理不善也会影响生意。

错位竞争不足 ：食堂档口在错位竞争方面可能不足，难以通过创新吸引顾客。

为了改善这些问题，学校应该采取措施加强食堂的监管和管理，确保食材质量和食品安全，合理定价，提高菜品质量，规范合同条款，优化供应链管理，减轻商户的资金压力，并加强员工培训和管理。