根据搜索结果，瑞士学费最低的大学主要集中在公立体系，且不同学校、专业及学制费用存在差异。以下是综合分析：

一、学费概况

日内瓦大学（UNIGE）

公立研究型大学，部分课程学费低至 500瑞士法郎/学期 （约3644人民币）。 - 优势：综合排名世界前100，涵盖科学、医学、人文等广泛领域，提供丰富的奖学金机会。

洛桑联邦理工学院（EPFL）

位于法语区，学费为 580瑞士法郎/学期 （约4064人民币）。 - 特点：国际化程度高，师生来自107个国家和地区，50%教授为外籍人员。

苏黎世联邦理工学院（ETH Zurich）

世界顶尖理工大学，学费为 700瑞士法郎/学期 （约9200人民币）。 - 亮点：2021年QS全球排名第6，以工程、数学等领域的科研实力著称。

二、其他选择

洛桑大学 ：学费为 580瑞士法郎/学期 （约4064人民币），但需注意其以法语授课，需具备相应语言能力。

苏黎世大学 ：未明确提及学费，但属于苏黎世联邦理工学院同校，费用可能相近。

三、注意事项

语言要求 ：洛桑大学要求法语水平，日内瓦大学和苏黎世联邦理工学院部分课程提供英文授课，但需提前确认。

奖学金机会 ：瑞士公立大学提供丰富的奖学金和助学金，可显著降低生活成本。

综合成本 ：瑞士公立大学年学费约 4000-7000瑞士法郎 （约人民币2.8-5.2万元），生活费用较高，建议提前规划预算。

综上， 日内瓦大学 的学费最低，但需结合语言要求及个人学术规划选择。苏黎世联邦理工学院和洛桑联邦理工学院在学术实力和国际化方面更具优势。