根据搜索结果，瑞士学费最低且综合实力较强的大学推荐如下：

一、学费最低的公立大学

日内瓦大学（UNIGE）

学费：每学期约500瑞士法郎（约合人民币3644元）

特点：瑞士顶尖公立研究型大学，以工程、医学等领域见长，环境优雅且服务完善。

洛桑联邦理工学院（EPFL）

学费：每学期约580瑞士法郎（约合人民币4092元）

特点：全球排名第二十六的工程类高校，计算机科学、人工智能等专业实力突出。

巴塞尔大学（University of basel）

学费：每学期约850瑞士法郎（约合人民币6000元）

特点：以生物医学、化学等学科闻名，科研经费充足。

伯尔尼大学（University of Bern）

学费：每学期约750瑞士法郎（约合人民币5600元）

特点：天文学、气候科学等领域的领先机构，学术氛围浓厚。

二、其他学费较低的选择

苏黎世联邦理工学院（ETH Zurich） ：每学期约700瑞士法郎（约合人民币5316元），综合排名全球第6位，工程、数学等学科顶尖。

洛桑大学（University of洛桑） ：每学期约580瑞士法郎（约合人民币4092元），日内瓦湖畔的美丽学府。

三、选择建议

优先考虑专业需求 ：工程、医学、商科等领域的学费差异不大，但需结合个人职业规划选择排名靠前的院校。

关注奖学金机会 ：瑞士高校奖学金种类丰富，部分项目可全免学费，建议提前申请。

综合成本评估 ：除学费外，生活费用、住宿等也会影响总花费，日内瓦大学等城市生活成本略低于苏黎世。

以上推荐综合了学费、学术实力及申请可行性，可根据个人情况进一步筛选。