薛其坤选择考研的原因主要包括以下几点：

追求科学梦想 ：薛其坤从小就立志成为一名科学家，认为科学可以为人类谋福祉。他坚信通过深造可以更好地实现自己的科学梦想。

弥补基础薄弱 ：在第一次和第二次考研中，薛其坤的数学和物理成绩都不理想，尤其是数学只考了39分。他意识到自己在数学和物理基础方面的不足，因此决定通过考研来加强这些基础知识。

坚持不懈 ：尽管前两次考研失败，薛其坤并没有放弃。他凭借坚定的信念和不懈的努力，最终在第三次考研中取得了成功，被中国科学院物理研究所录取。

经验和教训 ：通过前两次的失败，薛其坤积累了丰富的备考经验，并在第三次备考时更加有针对性地复习数学和物理基础知识，最终成功考入理想的研究生院。

科研技术提升 ：薛其坤在教学期间勤奋刻苦，踏实努力，认真对待每位学生，但他想要让自己的科研技术得到进一步提高。因此，他毅然选择了考研之路。

对科学的热爱 ：支撑薛其坤一路走来的，是他对科学纯粹的爱与乐。他回忆起自己的考研经历，感慨自己能有今天的成就，靠的是“三分天分，七分努力”。

综上所述，薛其坤考研是为了追求自己的科学梦想，弥补基础知识的不足，并在失败中不断积累经验，最终实现了自己的目标。