在职考研时，档案的处理方式主要有以下几种：

保留原档案 ：如果你计划在职期间考研，并且希望保留原档案的独立性，可以选择这种方式。档案可以存放在户籍所在地或居住地的人才市场或人事局。

合并档案 ：如果你在职期间考研成功后，不需要保留原档案，可以选择将在职考研档案与原档案合并。这样可以更好地管理和使用档案。

存放在学校 ：如果你在毕业院校所在地报考研究生，可以选择将档案存放在学校。但需要注意的是，学校通常只能为毕业生保留档案两年，两年后档案会被打回原籍。如果考上了研究生或者找到了工作，再去学校办理转档手续。

存放在人才市场 ：如果你在非学校所在地报考，或者希望将档案存放在户籍所在地或居住地，可以选择将档案存放在当地的人才市场。每年需要缴纳一定的管理费用。

转回原籍 ：如果你希望将档案拿回原籍，可以选择这种方式。以后无论是考研、考公还是工作，都可以直接从户口所在地调档。

存放在工作单位 ：如果你的工作单位具有档案管理权限，并且你希望在单位所在地参加考试，可以将档案存放在工作单位。

在处理在职考研档案时，请遵循以下步骤：

了解政策 ：首先，了解你所在地区和单位的档案管理政策。

准备材料 ：准备必要的材料，如录取通知书、调档函、身份证明等。

办理转档 ：与学校或人才市场联系，按照流程办理档案的转档手续。

确认档案 ：在档案转移完成后，及时查询档案是否完整，并在需要时提前预约使用。

建议提前规划好档案的调出和转入流程，确保档案能够顺利转移。同时，与原单位和学校保持密切沟通，确保在调档过程中出现问题时能够及时解决。