根据搜索结果，江苏省内考研难度较高的学校主要集中在顶尖综合类和特色鲜明的高校，具体分析如下：

一、综合类高校（王牌专业为主）

南京大学

综合实力顶尖，王牌专业集中在人文社科（如社会学、法学）和理学（如数学、物理学）领域，学术资源丰富但竞争激烈，复试分数线较高。

工科专业相对较弱，但计算机等新兴领域竞争加剧。

东南大学

985工程类高校，以土木工程、建筑学等传统优势专业著称，学科实力达A+，复试竞争压力大，尤其经济学、法学等专业需冲击A区国家线。

二、理工科特色院校

南京理工大学

工科优势显著，兵器科学与技术、光学工程等学科实力突出，报考热门专业竞争激烈，录取门槛较高。

河海大学

水利工程、环境科学领域全国领先，考研难度适中但需关注专业调剂名额。

苏州大学

多学科均衡发展，医学、管理学等专业较突出，整体竞争压力低于顶尖综合类但需注意热门专业调剂风险。

三、其他高难度院校

南京航空航天大学 ：航空航天领域实力强，复试分数线因专业差异较大。

江南大学 ：化学工程、材料科学等学科表现突出，报考人数逐年上升。

中国矿业大学 ：矿业工程、材料科学与工程等专业具有行业优势。

四、报考建议

目标为顶尖综合类 ：需提前规划复习时间，关注专业调剂信息，部分专业（如社会学、法学）竞争压力较大。

倾向工科或特色专业 ：东南大学、南京理工大学等院校提供优质科研平台，但需结合自身分数和职业规划选择。

关注复试要求 ：部分院校（如东南大学管理科学与工程）复试比例高达14:1，需提升综合竞争力。

综上， 南京大学 因综合实力和学科覆盖广度，整体考研难度最高； 东南大学 和 南京理工大学 在专业领域竞争尤为激烈。考生可根据自身情况制定备考策略。