东京大学作为日本顶尖的综合性大学，其研究生院提供广泛的研究学科，涵盖了人文、社会科学、教育、法律、政治、经济、工学、理学、医学、农业、生命科学等多个领域。具体学科设置如下：

人文社会系研究科 ：

基础文化研究专攻

日本文化研究专攻

亚洲文化研究专攻

欧美系文化研究专攻

社会文化研究专攻

文化资源学研究专攻

教育学研究科 ：

综合教育科学专攻

学校教育高度化专攻

法学政治学研究科 ：

法学、政治学等相关课程

经济学研究科 ：

经济理论专攻

现代经济专攻

经营专攻

工学系研究科 ：

建筑学

都市工学

机械工学

精密机械工学

系统创成学

航空宇宙工学

电气系工学

物理工学

材料工学

应用化学

化学工程

化学生命工学

先端学际工学

核工程与技术

生物工程

技术经营战略学

原子力

理学系研究科 ：

物理学

天文学

地球行星科学

化学

生物化学

生物科学

农学生命科学研究科 ：

生产·环境生物学

应用生命化学

应用生命工学

森林科学

水圈生物科学

农业･资源经济学

生物･环境工学

生物材料科学

国际农学

生物圈系统学

应用动物科学

兽医学

医学系研究科 ：

分子细胞生物学

机能生物学

病因･病理学

生体物理医学

脑神经医学

社会医学

内科学

生殖･发育･老化医学

外科学

健康科学･护理学

国际保健学

医科学

公共健康医学

药学系研究科 ：

分子药学

机能药学

生命药学

统合药学

药科学

数理科学研究科 ：

数理科学

新领域创成科学研究科

物质系

尖端能量工学

复杂理工学

尖端生命科学

基因组医学

自然环境学

系统环境学

人类环境学

社会文化环境学

国际协力学

海洋技术环境学

情报生命科学

公共政策研究科 ：

法政策专硕

经济政策专硕

国际公共政策专硕

公共管理专硕

综合文化研究科 ：

语言情报科学

超域文化科学

地域文化研究

国际社会科学

广域科学

美术研究科 ：

绘画学科

雕刻学科

工艺学科

设计学科

建筑学科

先端艺术表现学科

艺术学科

音乐研究科 ：

作曲科

声乐科

器乐科

指挥学科

乐理学科

音乐环境创造学科

映像研究科

这些学科覆盖了广泛的学术领域，为学生提供了多样化的研究方向和选择。建议申请者根据自己的兴趣和职业规划，选择合适的学科进行深入研究。