选择云南在职研究生专业时，可以从以下几个方面进行综合考虑：

个人兴趣与职业规划 ：

明确自己的兴趣所在及未来的职业规划，选择与之相匹配的专业。兴趣是最好的老师，能够激发学习动力，提升学习效果。

将个人兴趣与职业规划相结合，选择那些对职业发展有帮助的专业，使学习成果更好地服务于未来的工作实践。

专业实力与师资力量 ：

关注各专业的师资力量和学术实力。云南地区有多所知名高校，如云南大学、昆明理工大学等，不同专业在师资力量、科研水平及教学设施等方面存在差异。

通过查阅学校官网、咨询学长学姐或参加招生宣讲会等方式，了解各专业的具体情况，选择那些具有强大师资力量和良好学术氛围的专业。

就业前景与市场需求 ：

关注当前及未来一段时间内的人才市场需求趋势，选择那些具有广阔就业前景和较高市场需求的专业。

例如，随着数字化时代的到来，计算机科学与技术、软件工程等专业受到越来越多企业的青睐；而随着社会对管理人才的需求不断增长，工商管理、公共管理等专业也具有较高的就业竞争力。

专业热度与工作需要 ：

根据专业热度选择就读，热度高的专业通常就业领域更广阔。

根据自己的岗位需要选择专业，能够为之后的职业发展奠定基础。

经济能力 ：

考虑自己的经济实力，选择那些学费在自己承受范围内的专业，以保证能够安心的投入学习。

跨专业选择 ：

如果决定跨专业考研，建议先想好今后从事什么职业，然后再来反推专业。同时，尽量选择好就业且能跨考的专业，避免选择专业课难度较大的理工农专业。

学校选择 ：

根据办学理念、地理位置等因素选择合适的院校。选择教学质量高且师资水平好的院校，同时考虑院校是否为国家重点支持建设的高校。

课程设置 ：

了解不同专业的课程设置，选择那些偏重于实际应用或与自己工作需求更匹配的课程设置。

综上所述，选择云南在职研究生专业时，应综合考虑个人兴趣、职业规划、专业实力、就业前景、经济能力等多个因素，以确保选择到最适合自己的专业。