物流工程研究生主要学习的课程内容包括以下几个方面：

物流管理 ：学习物流管理的理论和实践，包括供应链管理、仓储管理、运输管理等，掌握物流规划、物流网络设计、物流运作流程优化等技能。

物流信息技术 ：学习物流信息系统的应用和管理，包括物流信息采集、处理、传输和分析等方面的知识，掌握物流信息系统的设计和运维。

物流优化技术 ：学习运筹学和优化方法在物流系统中的应用，如线性规划、整数规划、模拟仿真等技术，通过优化提高物流效率和服务质量。

物流战略与政策 ：学习物流战略规划和政策法规的知识，了解物流行业发展趋势，具备制定物流战略和应对市场挑战的能力。

专业实践和案例分析 ：通过实践项目、实习和案例分析，提升学生在物流实践中的应用能力和解决问题的能力，培养团队合作、项目管理和决策分析等方面的技能。

学术课程 ：包括数学建模与优化、物流系统工程、物流运作管理、供应链管理、国际物流与贸易、物流与环境保护、科研方法与论文写作、工程伦理与专业道德等。

物流与供应链管理基础理论 ：包括供应链管理的定义、结构、战略规划、合作伙伴关系管理、风险管理和绩效评估。

物流系统分析与设计 ：包括物流网络设计、库存管理、运输管理、仓库管理等。

物流设施设备与自动化技术 ：包括物流设备的功能、特点及其在实际操作中的应用，如自动分拣系统、自动化仓储系统等。

物流项目管理 ：包括项目范围管理、时间管理、成本管理、质量管理、人力资源管理、沟通管理、风险管理等。

物流经济与政策法规 ：包括物流经济学的相关知识，以及物流行业相关的政策法规。

国际物流与贸易实务 ：包括国际物流运作模式、国际贸易理论与实务等。

这些课程内容旨在培养学生掌握物流设施应用、系统规划设计与评价、物流运作管理等先进技术与方法，使其具备独立担负物流技术和运作管理工作的能力。