同等学力申硕有以下几个明显的劣势：

无法提升学历 ：同等学力申硕属于非全日制学习，学员最终只能获得硕士学位证书，而无法取得学历证书，这意味着其学历并没有得到提升。

报考要求较高 ：想要参加同等学力申硕的学员需要满足一定的条件，例如本科学历并获得学士学位满3年，这对于专科学历的学员来说是一个较大的限制。

知识体系不完整 ：由于非全日制学习的特点，同等学力考生的知识体系可能不够完整，需要在复习过程中进行系统性的梳理。

学习时间不足 ：许多同等学力考生因为工作、家庭等原因，学习时间有限，需要在有限的时间内高效地完成学习任务。

缺乏备考经验 ：由于非全日制学习与全日制学习的差异，同等学力考生在备考过程中可能会遇到一些意想不到的问题，缺乏备考经验。

可报考的院校和专业较少 ：相对于全日制研究生，同等学力在职研究生可报考的院校和专业相对较少，选择范围有限。

学习基础相对薄弱 ：同等学力考生在学习过程中可能面临基础薄弱的问题，需要花费更多的时间和精力进行学习和巩固。

考试难度较大 ：尽管同等学力申硕的考试难度相对较低，但仍然需要认真备考，且考试机会有限，需要在4年内通过考试。

综上所述，同等学力申硕虽然有免试入学、考试难度低等优势，但其劣势也不容忽视。学员在选择这种方式时，需要根据自己的实际情况和需求进行权衡。如果主要目标是获得硕士学位证书，并且具备相应的工作经验和学习时间，同等学力申硕是一个值得考虑的选择。但如果希望提升学历或报考院校和专业选择更多，可能需要选择其他报考方式。