东南大学与东北大学在以下几个方面存在区别：

地理位置 ：

东南大学位于江苏省南京市，是南京的江苏省省会城市、新一线城市。

东北大学位于辽宁省沈阳市，是沈阳的辽宁省省会城市、二线城市。

办学层级 ：

东南大学和东北大学都是教育部直属的全国重点大学，是国家“985工程”、“211工程”、“双一流”建设高校。

占地面积 ：

东南大学占地面积为5888亩，比东北大学的3825亩多2063亩，占有较大优势。

校区设置 ：

东南大学有多个校区，包括四牌楼校区、丁家桥校区和九龙湖校区。

苏州校区目前仅招收研究生，不招收本科生，与本部校区无法横向比较。

学科特色 ：

东南大学是一所以工科为主要特色的综合性、研究型大学，涵盖哲学、经济学、法学、教育学、文学、理学、工学、医学、管理学、艺术学、历史学等多个学科。

东北大学的具体学科特色未详细列出，但作为一所重点大学，也拥有多个学科领域。

历史沿革 ：

东南大学始建于1902年，前身为三江师范学堂，有着悠久的办学历史。

东北大学的历史也较为悠久，但具体起源和发展过程与东南大学有所不同。

综上所述，东南大学与东北大学在地理位置、办学层级、占地面积、校区设置、学科特色和历史沿革等方面存在一定的区别。东南大学以工科见长，且拥有多个校区和丰富的学科领域，而东北大学则作为另一所重点大学，在多个学科领域也有显著成就。