北京自主命题的原因主要包括以下几点：

适应首都特点 ：北京作为中国的首都，具有独特的文化、经济和社会发展特点。自主命题可以更好地反映北京考生的综合素质和能力，因为北京考生接受现代信息较快，城乡差别较小。

反映综合素质 ：自主命题可以更灵活地选择考试内容，更好地符合北京地区的教学特点和要求，从而更准确地考察考生的综合素质和能力。

教育多元化改革 ：面对社会对教育多元化要求的提升，自主命题能够促进高考改革，推进教育发展，为培养全面发展的人才提供更好的途径和保障。

体现地方特色 ：自主命题有利于体现北京等地区的教育特色，便于高校有针对性地选拔符合本地要求的人才。

公平性问题 ：全国统一考试对其他地区的考生可能不公平，因为北京等地区的高考卷可能包含独特的“京味”内容，而其他地区考生可能无法完全适应。

新题型引领 ：北京总是率先全国出现新题型，自主命题可以让北京的高考试卷保持一定的创新性，引领教育考试的潮流。

避免直接比较 ：自主命题为北京等自主命题省市提供了一定的“保护色”，避免了外界对它们教育质量的直接质疑。

综上所述，北京自主命题主要是为了适应首都地区的特殊情况和需求，更好地反映考生的综合素质和能力，促进教育公平和改革，以及体现地方特色。