厦门大学MEM和福州大学MEM各有其优势，具体选择哪个更好需要根据个人的需求和目标来考虑。以下是它们的一些比较：

学校排名和综合实力 ：

厦门大学是985高校，全国排名较高，综合实力较强，名气大。

福州大学是211高校，虽然排名较厦门大学低一些，但也是国家“双一流”建设高校，工科实力较强。

师资力量和课程设置 ：

厦门大学MEM项目师资力量雄厚，课程设置科学，注重实践教学和案例分析，致力于培养具有国际视野和创新能力的高级工程管理人才。

福州大学MEM项目注重理论与实践相结合，课程设置涵盖了工程管理领域的各个方面，培养具备扎实理论基础和实践能力的工程管理人才。

学费和授课方式 ：

厦门大学MEM学费为12.8万元/全程，学制3年，授课方式为周末班。

福州大学MEM学费为8.6万元/全程，学制3-5年，授课方式也是周末班。

就业情况 ：

厦门大学的就业指导中心网站显示，学校几乎每天都有两到三场的校园宣讲会，就业情况较好。

福州大学的就业情况相对较少，但近年来排名有所上升，显示出其就业前景也在改善。

个人选择 ：

如果个人更看重学校的名气、综合实力和就业情况，且经济条件允许，厦门大学MEM可能是一个更好的选择。

如果个人更看重学校的工科实力、学费相对较低以及较长的学制（3-5年），福州大学MEM也是一个值得考虑的选择。

综上所述，厦门大学MEM和福州大学MEM各有优势，具体选择哪个更好需要根据个人的需求和目标来综合考虑。建议可以进一步了解两校的就业情况、课程设置和师资力量，以便做出更明智的选择。