选择考研学校时，哈尔滨工程大学（哈工程）可能会面临一些挑战和不利因素。以下是一些不推荐报考哈工程的原因：

地理位置偏远 ：哈工程位于黑龙江省，地理位置相对较偏，这可能使得一些考生不愿意报考，导致生源质量不高。

竞争压力较大 ：哈工程是知名的211高校，吸引了大量学霸级考生，竞争压力较大。此外，北方的气候寒冷也可能让一些南方学生望而却步。

部分专业复试分数线高 ：近年来，哈工程的考研难度上升，部分专业的复试分数线较高，且高分考生较多，竞争激烈。

专业难度 ：哈工程的部分专业，如自动控制原理，难度极大，高分率很低。此外，哈工程在控制弱电方面实力较强，但与电网对口的专业较少，就业方向主要集中在航天、船舶类研究所以及一些外企，这可能不符合部分考生的职业规划。

研究生课程和研究项目难度高 ：哈工程的研究生课程和研究项目具有较高的难度，要求学生具备扎实的数学和物理基础，这对一些考生来说是一个挑战。

跨校和跨专业要求高 ：相对于考本校，跨校和跨专业的要求更高，这可能增加考研的难度和不确定性。

经济因素 ：东北地区的经济近年来走下坡路，导致人才流失严重，很多优秀学生选择去东南沿海地区发展，这也可能影响了哈工程考研的报名人数。

招生政策 ：哈工程作为一所军工类学校，每年的招生指标有严格规定，且在每个省份的招生数量是固定的。这种招生政策可能使得一些省份的学生因为名额限制而无法报考。

学校声誉和认可度 ：虽然哈工程在军工领域有很高的声誉，但在其他领域的认可度可能相对较低，这也可能影响一些考生的报考意愿。

综上所述，虽然哈尔滨工程大学在某些方面具有优势，如理工科实力强劲、就业前景不错，但考虑到地理位置、竞争压力、专业难度等因素，考研时选择哈工程可能需要较大的勇气和努力。建议考生在报考前充分了解自身情况和目标专业的具体情况，权衡利弊，做出明智的选择。