制药专业考研的顶尖学校包括：

天津大学 ：以A+评级并列榜首，教学和科研实力国内领先。

四川大学 ：以A+评级并列榜首，教学和科研实力国内领先。

中国药科大学 ：以A+评级并列榜首，教学和科研实力国内领先，且是唯一入选教育部“卓越工程师教育培养计划”的医药院校。

华东理工大学 ：以A+评级并列榜首，教学和科研实力国内领先。

大连理工大学 ：以A评级位列其后，教学和科研实力不俗。

北京化工大学 ：以A评级位列其后，在药物合成和工艺优化方面研究实力强。

北京大学 ：国内顶尖大学之一，制药专业师资力量雄厚，教学设施条件好，且与国际知名制药公司有良好的合作关系。

复旦大学 ：国内制药行业的重心地带，制药专业师资力量雄厚，教学设施齐全，拥有颇具影响力的科研成果。

浙江大学 ：国内制药行业权威之一，制药专业在国内处于较高地位，教师团队素质高、实验条件好、教学质量高水平。

南京工业大学 ：在药物制剂和药物分析方面研究实力强。

西安交通大学 ：在药物研发和生产技术方面研究实力强。

清华大学 ：综合实力强，提供多元化的学术环境。

建议：

顶尖院校 ：如果追求国内顶尖的制药工程专业教学和科研水平，天津大学、四川大学、中国药科大学、华东理工大学、大连理工大学和北京化工大学是理想的选择。

区域优势院校 ：武汉轻工大学和江苏师范大学等区域性院校在本地有较高声誉，也是不错的选择。

专业特色 ：如果对药学类特定领域感兴趣，中国药科大学和沈阳药科大学等药学特色突出的高校更为合适。

综合考量 ：考生应根据自身兴趣、专业背景和职业规划，综合考虑学校排名、师资力量、实验设施、科研水平及就业前景等因素，选择最适合自己的院校。