在考研微生物专业方面，以下几所学校被认为是顶尖的选择：

北京大学 ：作为国内一流的综合性大学，北京大学在微生物考研领域具有举足轻重的地位。其生命科学学院的微生物学系拥有优秀的师资队伍和先进的实验设备，研究方向涵盖了微生物基因组学、微生物生态学、微生物代谢工程等热门领域。

清华大学 ：清华大学生命科学与技术学院在微生物考研领域也有着举足轻重的地位，拥有优秀的师资队伍和先进的实验设备，致力于培养具有国际竞争力的微生物学人才。

上海交通大学 ：该校的微生物学专业是国内颇具声望的微生物学专业之一，研究自然科学和医学的结合，旨在培养兼具理论基础和实践能力的优秀学者和全面发展的医学人才。

中国农业大学 ：微生物学与病原生物学专业是国内微生物学专业的优秀代表之一，学院教师团队具有较高的学术水平与丰富的教学经验，研究方向包括微生物遗传学、微生物代谢工程、微生物分子生物学、微生物生态学、微生物发酵工程等多个领域。

复旦大学 ：复旦大学生命科学学院的微生物学方向一直以其严谨的学风和卓越的教学质量而蜚声国内外，学院的师资力量强大，多位教授在微生物领域拥有丰富的研究经验和卓越的学术成果。

华中农业大学 ：虽然竞争激烈，但华中农业大学在微生物学考研领域也备受赞誉，其微生物专业属于生物学专业中考研热度比较大的一门专业。

武汉大学 ：武汉大学在微生物学领域具有很高的水平，是中国微生物学的主要培养基地之一，拥有一批具有较高学术声誉和影响力的科研团队。

南京大学 ：南京农大在微生物学考研领域也位列前茅，其微生物领域具有较深的积累，在研究方面具有一定的优势。

建议

选择考研微生物专业的学校时，建议综合考虑学校的学术声誉、师资力量、实验设备、研究方向以及个人兴趣和职业规划。如果竞争激烈，可以考虑选择那些虽然排名较高但相对好考的学校，如华中农业大学。同时，也可以考虑那些在特定研究领域具有特色的学校，以便更好地发挥自己的优势。