在昌吉州考研，以下几个专业是比较好的选择：

临床医学专业 ：

考研方向 ：内科学、外科学、急诊医学、临床医学、肿瘤学、眼科学、老年医学、神经病学、神经病与精神卫生学、麻醉学等。

优势 ：临床医学专业非常看重学历和经验，考研可以提高自身价值，增加就业机会。特别是三甲医院，对学历的要求更高，本科学历的毕业生多数只能在乡镇医院就业。

法学专业 ：

考研方向 ：通过推免或考试方式选择到中国国内外高校、科研院所继续深造，攻读法学及相关学科硕士、博士学位。

优势 ：我国是法治社会，对法律专业的人才需求量大，但本科学习的内容较为初级，考研可以积累更多经验和知识，提高就业竞争力，进入大城市律师事务所工作。

计算机科学与技术专业 ：

优势 ：计算机专业是当前炙手可热的专业，考研可以进一步深入学习，提升专业技能和竞争力，就业前景广阔。

教育学 ：

优势 ：教育学专业就业前景较好，尤其是小学教育和学前教育专业，实用性强，就业率达到95%以上。

金融学 ：

优势 ：金融学专业就业前景广阔，可以在银行、证券公司、保险公司等金融机构工作。

工商管理 ：

优势 ：工商管理专业涉及企业管理、市场营销、财务管理等多个领域，就业方向多样。

医学专业 ：

考研方向 ：内科学、外科学、妇产科学、儿科学等。

优势 ：医学专业同样看重学历和经验，考研可以提高就业竞争力，进入更好的医院工作。

会计学专业 ：

优势 ：会计学专业就业前景广阔，可以在企业、会计师事务所、金融机构等工作。

汉语言文学专业 ：

优势 ：汉语言文学专业在昌吉学院是热门专业，师资力量强，科研水平高，就业率也较高。

电气自动化技术专业 ：

优势 ：该专业是昌吉学院的王牌专业之一，实用性强，就业前景好。

根据以上信息，建议选择专业时，可以根据自己的兴趣和职业规划来决定。如果希望进入医疗行业，临床医学专业是一个不错的选择；如果希望从事法律相关工作，法学专业值得考虑；如果对计算机技术感兴趣，计算机科学与技术专业是一个热门选择；如果希望从事教育行业，教育学、小学教育等专业较为推荐；如果对金融、管理等领域感兴趣，金融学专业和工商管理专业也是不错的选择。