合肥和郑州都是中国的重要城市，且都拥有知名高校，因此考研的选择需根据个人偏好和职业规划来决定。以下是它们的一些比较：

综合实力 ：

郑州大学 ：郑州大学是河南省唯一一所211工程、国家双一流世界一流大学建设高校，拥有较高的教育质量和研究实力。土木工程学科是该校的省一级重点学科，整体实力略胜合肥工业大学。

合肥工业大学 ：合肥工业大学是211工程大学，全国排名大约60左右，虽然整体实力略逊于郑州大学，但在某些领域如机械工程、电气工程等方面具有较强优势。

专业优势 ：

郑州大学 ：在土木工程、凝聚态物理和材料加工工程等专业方面较为突出，考研难度相对较低，尤其是对于河南省内的考生。

合肥工业大学 ：在机械工程、电气工程、计算机科学与技术等专业方面较为强势，考研难度相对较低，尤其是对于达到国家二区线的考生。

地理位置 ：

郑州 ：位于河南省，虽然是内陆城市，但交通发达，且近年来经济发展迅速，就业实习机会较多。

合肥 ：位于安徽省，虽然经济相对欠发达，但教育资源和科研实力较强，尤其是与中国科技大学等高校相邻，学术氛围浓厚。

考研难度 ：

郑州大学 ：考研难度相对较低，尤其是对于河南省内的考生，过线即可录取，部分专业还会接受调剂。

合肥工业大学 ：考研难度也较低，达到国家二区线即可录取，部分专业录取情况较为乐观。

建议

如果你对土木工程、凝聚态物理和材料加工工程等专业感兴趣，且希望留在河南省内发展，郑州大学是较好的选择 。

如果你对机械工程、电气工程、计算机科学与技术等专业感兴趣，或者希望留在安徽省内发展，合肥工业大学是不错的选择 。

综合考虑个人兴趣、专业前景和就业方向，选择最适合自己的学校 。

希望这些信息对你有所帮助，祝你考研顺利!