以下是一些专业菌种制作厂家的排名：

安琪酵母 （安琪酵母股份有限公司）

成立时间 ：1986年

主要产品 ：面用酵母、食品原料、酵母抽提物、酿酒酵母、营养酵母、饲用酵母、酶制剂等

产能 ：酵母类产品总产能超过30万吨

市场 ：产品出口到全球160多个国家和地区

川秀 （北京川秀科技有限公司）

成立时间 ：2003年

主要产品 ：酸奶粉、酒曲等

市场 ：国内知名益生菌提供商

佰生优 （昆山佰生优生物科技有限公司）

成立时间 ：2011年

主要产品 ：乳酸菌发酵剂

市场 ：专业从事乳酸菌研发与运用的民营科技型企业

润盈 （均瑶润盈生物科技（上海）有限公司）

成立时间 ：2006年

主要产品 ：益生菌菌粉、发酵剂、功能性食品及衍生产品

产能 ：年产高活性冻干菌粉超千吨

市场 ：国内较具规模的益生菌生产商

IFF（原杜邦）

主要产品 ：NCFM、HN001、HN019等菌株及Howaru大健康解决方案益生菌

市场 ：全球益生菌市场占有率最高的企业之一，国内没有单独的益生菌原料生产工厂，供应国内益生菌原料均为进口

诺维信（科汉森）

主要产品 ：工业酶制剂和微生物制剂，如动物双歧杆菌Bb-12®、鼠李糖乳杆菌LGG®

市场 ：生物解决方案领域的全球先导，国内没有益生菌原料生产基地，益生菌原料从海外进口

微康益生菌

市场 ：具体情况不详，但属于较为知名的益生菌品牌

天水众兴菌业科技股份有限公司

主要产品 ：食用菌（如金针菇）

市场 ：专门从事食用菌研发、生产、销售的农业产业化企业

如意情生物科技股份有限公司

主要产品 ：金针菇等食用菌

市场 ：主要从事金针菇等食用菌的研发和生产

雪榕

主要产品 ：金针菇、蟹味菇、白玉菇等

市场 ：科研、养殖、销售于一体的综合性企业

这些企业在菌种制作领域具有较高的知名度和市场占有率，涵盖了从原料生产到终端产品的全产业链。建议根据具体需求选择合适的企业进行合作。