员工培训费用在计算企业所得税时可以进行抵扣，具体抵扣比例和条件如下：

一般企业 ：

职工教育经费支出在不超过工资薪金总额的2.5%部分，可以在计算企业所得税应纳税所得额时扣除；超出部分可以在以后的纳税年度结转扣除。

高新技术企业和技术先进型服务企业 ：

职工教育经费支出在不超过工资薪金总额的8%部分，可以在计算企业所得税应纳税所得额时扣除；超出部分可以在以后的纳税年度结转扣除。

集成电路设计企业和符合条件的软件企业 ：

职工培训费用可以全额扣除。

动漫企业 ：

职工培训费用可以全额扣除。

核力发电企业 ：

培养核电厂操纵员发生的费用可以作为发电成本在税前扣除，但员工实际发生的职工教育经费支出不得直接扣除。

个体工商户、合伙企业、个人独资企业 ：

职工教育经费税前扣除限额标准为2.5%。

综上所述，企业在计算企业所得税应纳税所得额时，可以抵扣的员工培训费用取决于企业的类型和培训费用是否超过规定的比例。一般企业不超过工资薪金总额的2.5%部分可以当期抵扣，而高新技术企业和技术先进型服务企业等特定行业的企业则可以达到8%的比例。超出部分可以在以后的纳税年度结转扣除。对于集成电路设计企业、符合条件的软件企业和动漫企业，职工培训费用可以全额扣除。