以下是一些在研究生入学考试中实行专业课自主命题的大学：

北京大学

清华大学

浙江大学

上海交通大学

复旦大学

南京大学

武汉大学

华中科技大学

北京理工大学

北京航空航天大学

中国科学技术大学

南开大学

天津大学

东南大学

西安交通大学

哈尔滨工业大学

中山大学

华南理工大学

四川大学

电子科技大学

大连理工大学

同济大学

兰州大学

北京师范大学

中国政法大学

华北电力大学

中国石油大学(北京)

北京化工大学

北京语言大学

中国传媒大学

中央财经大学

对外经济贸易大学

中国海洋大学

中国人民大学

这些大学通常是顶尖的985工程高校，自主命题的专业课考试内容和形式由各校自行决定，反映了各自院校的教学特色和研究方向。

还有一些其他大学也在特定年份或特定专业中实行自主命题，例如：

大连大学：2025年硕士研究生入学考试部分自命题考试科目和参考书目调整通知。

华东师范大学：2025级金融等专硕招生初始考试科目调整为自命题的“396-经济类联考综合能力”。

黑龙江中医药大学：中西医结合影像专业、医学技术专业等专业考试科目调整为自主命题。

江西科技师范大学：拟将教育专业的教育综合(自命题)更改为全国统考333。

请注意，以上信息可能会有所变动，建议直接咨询相关院校或访问官方网站获取最新信息。