东南大学设有36个院系，涵盖90个本科专业，学科门类广泛，包括哲学、经济学、法学、教育学、文学、理学、工学、医学、管理学、艺术学、历史学等。以下是一些主要学院及其专业：

建筑学院：建筑学、城乡规划、风景园林。

机械工程学院：机械制造、机械电子、机械设计、工业工程、工业设计、车辆工程。

能源与环境学院：热能与动力工程、建筑环境与设备工程、环境工程、核工程与核技术。

信息科学与工程学院：通信与信息系统、信号与信息处理、电路与系统、电磁场与微波技术。

土木工程学院：土木工程、工程管理、智能建造、工程力学。

电子科学与工程学院：电子科学与技术、光学工程。

数学学院：数学与应用数学、信息与计算科学、统计学。

自动化学院：自动化、机器人工程。

计算机科学与工程学院：计算机科学与技术。

软件学院：软件工程。

人工智能学院：人工智能。

物理学院：物理学、应用物理学。

生物科学与医学工程学院：生物医学工程、生物信息学、智能医学工程。

材料科学与工程学院：金属材料、土木工程材料、电子信息材料、材料加工。

人文学院：政治学与行政学、汉语言文学、旅游管理、社会学、哲学。

经济管理学院：管理学类（信息管理与信息系统、工商管理、会计学、电子商务、物流管理）、经济学类（国际经济与贸易、金融学、经济学、金融工程）。

电气工程学院：电气工程及其自动化。

外国语学院：英语、日语。

化学化工学院：化学工程与工艺、制药工程、化学。

交通学院：交通工程、交通运输、道路桥梁与渡河工程、城市地下空间工程、测绘工程、港口航道与海岸工程。

仪器科学与工程学院：测控技术与仪器、智能感知工程。

艺术学院：产品设计、美术学、动画。

法学院：法学、工程法。

医学院：临床医学、医学检验。

公共卫生学院：预防医学、劳动与社会保障（医疗保险方向）。

网络空间安全学院：网络空间安全。

吴健雄学院：工科试验班（吴健雄班）。

东南大学还有一些特色专业，如建筑学、土木工程、生物医学工程、机械工程及自动化等，这些专业在全国享有较高的声誉。

如需更详细的专业信息，可以参考东南大学官网或相关招生简章。