上海南汇区拥有多所知名高等院校，以下是一些位于该区的高校：

上海海洋大学：以海洋、水产、食品学科为特色，农、理、工、经、管、文、法等学科协调发展的多科性应用研究型大学。

上海电力大学：中央与上海市共建、以上海市管理为主的全日制普通高等院校，以工为主，兼有理、管、经、文等学科。

上海理工大学：以工为主，工学、理学、管理学、文学、艺术学等多学科协调发展的全国重点大学。

上海师范大学：以师范教育为主体，文理、工、管、法、艺多学科协调发展的全日制普通本专科高校。

上海对外经贸大学：以经济、管理类学科为主的全日制普通本专科高校。

上海立信会计金融学院：以财经类专业为主的全日制普通本专科高校。

上海工商外国语职业学院：民办全日制普通高等院校，坐落于浦东航空港与洋山深水港之间。

上海思博职业技术学院：全日制高等职业技术学院，位于上海市浦东新区南汇大学城。

上海建桥学院：应用型、营利性全日制民办高校，开设工学、经济学、文学、教育学、管理学多个学科。

上海电机学院：面向先进制造业及现代服务业，以工学为主，多学科协调发展的普通高等院校。

上海新知学院：具有独立办学资格的高等院校，提供金融管理、行政管理、会计、物流管理、财务管理等热门专业。

上海民航职业技术学院：始源于1980年，在民航上海管理局教导队基础上成立的民航上海管理局技工学校。

这些大学为当地及周边地区提供了丰富的高等教育资源，涵盖了工、理、文、法、经、管、教育、艺术等多个学科领域。