南京驾照科目二的费用如下：

培训费用 ：

一般驾校的C1手动挡培训费用大约在2900-4300元之间，具体费用可能因驾校和提供的服务（如是否包含考试费）而异。科目二培训费用，以小型手动挡汽车（C1车型）为例，理论培训费大约为10元/小时，操作培训费大约为57元/小时。一些驾校可能会提供VIP服务，费用可能会更高，例如4300-4500元左右。

驾校报名费一般在3000 - 5000元之间，其中C1驾驶证学费主要集中在3000 - 4000元之间。具体来看，报名费交给驾校，通常在2500 - 2800元，之后练车一般不再收费。

考试费用 ：

科目二考试费，根据2023年的标准，科目一为30元，科目二为140元，科目三为90元。

其他费用 ：

模拟费是自愿选择的，科目二最低套餐360元，包括倒库6遍和电子路考8圈；科目三考场线路不同价格不同，一条线的考场150元，多条线的考场300 - 450元。

体检费一般在100元左右。

综合以上信息，南京驾照科目二的培训费用大约在1000-2000元之间，考试费用为140元。此外，学员还需考虑其他费用如模拟考试费和体检费等。建议您向所在驾校咨询具体的费用信息，以确保您获得最准确的费用情况。