收购公司在进行入账时，需要遵循以下步骤：

资产评估与入账 ：

对被收购公司进行资产评估，包括固定资产、无形资产、流动资产等。

根据评估结果，在公司账簿中开设相应科目，并将评估价值入账。

支付收购款项并记录 ：

通过银行转账等方式支付收购款项，并在公司账簿中记录该笔支出，同时明确标注为“收购xx公司款项”。

股权变更与账务处理 ：

完成股权变更手续后，根据公司章程及会计准则，将被收购公司的股权纳入本公司资产负债表，同时调整相关科目余额。

整合财务报表 ：

将被收购公司的财务报表与本公司报表进行整合，确保数据准确无误，反映公司整体财务状况。

税务处理 ：

根据税法规定，申报并缴纳因收购产生的相关税费，如印花税、契税等，并在账簿中做好相应记录。

后续跟踪与审计 ：

定期对收购后的公司进行财务跟踪，确保其运营状况符合预期，并接受外部审计，确保账务处理的合规性。

此外，对于企业合并情况下的会计处理，还应遵循以下规定：

在吸收合并的情况下，合并方对同一控制下吸收合并中取得的资产、负债应当按照相关资产、负债在被合并方的原账面价值入账。

合并方在确认了合并中取得的被合并方的资产和负债后，以支付现金、非现金资产方式进行的该类合并，所确认的净资产入账价值与支付的现金、非现金资产账面价值的差额，相应调整资本公积（资本溢价或股本溢价），资本公积（资本溢价或股本溢价）的余额不足冲减的，应冲减盈余公积和未分配利润。

对于被收购公司收到收购公司款项的，一般是计入到公司的实收资本中，是属于股东的出资。

在实际操作中，建议咨询专业的财务顾问，以确保账务处理的准确性和合规性。