日本的名贵树种包括：

竹炭樱 （Chikutanizakura） ：极为罕见的黑色樱花树，被认为是国宝级别的珍品。

五月笋の松 （Satsuki-take no Matsu） ：九州地区广受赞赏的五月竹松树，被视为有价值的珍贵树木。

招福桃 （Maneki-neko Momo） ：独特的白色桃树，因其罕见的外观而受到推崇和收藏。

雪松 （Yukitsugawa） ：云南松，在日本凤凰县被认为是最有价值和最美丽的树木之一。

杂交草樱 （Kashima-cherry） ：顶级的草樱花树，在日本春季樱花季备受欢迎。

赤松 （Pinus densiflora 'Umbraculifera'） ：矮小而稀有的赤松品种，以其浓密的圆形树冠和扁平枝条而著名。

柳杉 （Cryptomeria japonica 'Bihou'） ：古老的日本针叶树，'Bihou'是珍稀的变异品种，四季色彩多变。

银杏叶松 （Ginkgo biloba 'Mariken'） ：迷你型的银杏叶松品种，生长缓慢，形成紧凑的球形树冠。

红果垂松 （Pinus densiflora 'Pendula'） ：具有优雅枝条的赤松品种，因其罕见性和装饰价值而珍贵。

五针松 （Pinus parviflora） ：日本最具代表性的松树之一，适合园林盆栽，具有高观赏价值。

黑松 、 大阪松锦 、 松雪松 ：在日本也较为出名。

刺叶枫 （Acer palmatum） ：日本的名贵枫树品种之一。

日本桧木 ：常绿乔木，以其特殊的纹理、美丽的颜色和耐久性而受到青睐。

蓝针松 （Pinus parviflora 'Glauca'） ：针叶呈现蓝灰色调的日本五针松品种。

这些树种因其独特的叶子形状、颜色、纹理以及在日本文化中的象征意义而备受珍视