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预测一个转录因子可以调控哪些microrna的表达,求大佬施舍一个解决方案,感激不尽!
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转录因子一半都结合在被调控基因的promoter区域,可以做一个chip-seq实验,然后在基因组数据库中定位这些与该转录因子结合的DNA区域.那么这些区域的下游附近的基因就很可能是受该转录因子调控的基因。
然后在针对这些疑似基因做转录因子KO之后的该基因mRNA水平检测(realtimePCR)确定是否受其调控。
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本文概览:转录因子一半都结合在被调控基因的promoter区域,可以做一个chip-seq实验,然后在基因组数据库中定位这些与该转录因子结合的DNA区域.那么这些区域的下游附近的基因就很可能是受该转录因子调控的基因。然后在针对这些疑似基因做转录因子KO之后的该基因mRNA水平检测(realtimePCR)确定是否受其调控。