六安卫校提供了丰富的学科专业选择，以满足不同教育阶段的需求。学校设有三年制中专专业7个，包括医学、护理等相关领域，为学生打下坚实的基础。同时，学校还提供四年制中专专业2个，以及普通大专专业3个，涵盖了临床医学、高等护理和五官医学等专业，为学生提供更高级别的教育机会。

在实践教育方面，六安卫校与省内外47个实习基地建立了稳定的合作关系，为学生提供宝贵的实践经验。此外，1991年，学校设立了省乡村医生培训中心，设立43个函授点，为乡村医生提供培训和管理服务，体现了学校的社区服务精神。

1993年起，六安卫校与安徽医科大学合作，成为成人大专学历教育的教学点，进一步扩大了教育范围。1999年，学校升级为安徽医科大学的教学点，开始招收普通大专学生，致力于提供高质量的高等教育。2002年和2022年，学校分别与安医大和安徽中医药高等专科学校合作，增设了五年制高职教育，包括中医类专业，进一步丰富了学校的专业目录。

目前，六安市政府正积极推动学校的扩建和升格，目标是将六安卫校建设为“六安医学高等专科学校”。学校现有在校生2100余人，其中大专和高职生占较大比例，这显示了学校在人才培养方面的成就和未来发展的潜力。全体教职员工正全力以赴地投入申报工作中，期待学校能在学术和教育质量上实现新的飞跃。