广东科贸职业学院目前设有 13个二级及以上特色学院 ，涵盖农林牧渔、工科、经管、艺术设计、财经管理等多个领域，具体如下：

动物科技学院

省级重点培育专业，涵盖畜牧兽医、宠物医学、水产养殖技术等方向，承担“千生连千村服务千万户”社会服务项目。

园林学院

拥有省级重点特色专业园艺技术、茶艺等，注重环境艺术设计与园林工程实践能力培养。

食品生物学院

重点建设专业包括食品加工技术、化妆品技术与管理，与韶关学院合作开展三二分段培养。

信息学院

设有计算机网络技术、嵌入式技术与应用等专业，注重信息化与智能化人才培养。

艺术设计学院

覆盖环境艺术设计、茶艺等方向，强调创意设计与实践结合。

商贸学院

包含国际商务、电子商务等专业，支持高本衔接和1+X证书制度。

外语学院（国际交流学院）

提供商务英语、应用英语等课程，开展国际交流与合作。

管理学院

设有工商企业管理、会计电算化等专业，其中工商企业管理为省级示范建设专业。

会计学院

重点建设会计电算化、连锁经营管理等专业。

其他特色学院

包括信息与自动化学院（计算机相关）、经济管理系（工商管理等）、人文外语系（商务英语等）。

校区分布

学校现有广州白云石井校区、天河五山校区、清远校区三个主校区，占地面积1100亩，建筑面积28万平方米。