北京中医药大学设有多个教学单位和本科专业，涵盖了中医、中药、生命科学、针灸推拿、管理、护理等多个领域。具体院系和专业设置如下：

中医学院 ：提供中医学专业，包括七年制科研方向、七年制中西医结合方向、七年制中医骨伤方向、七年制中医临床方向、五年制等。

中药学院 ：提供中药学、中药制药等专业。

生命科学学院 ：成立于2016年，专注于生命科学领域的研究。

针灸推拿学院 ：提供针灸推拿学等专业。

管理学院 ：包括卫生管理系、工商管理系，提供公共事业管理、工商管理、信息管理与信息系统、健康管理等专业。

护理学院 ：提供护理学专业。

人文学院 ：前身为文法系，后更名为人文学院，包含英语（医学、中医药国际传播）、法学（医药卫生）等专业。

马克思主义学院 ：专注于马克思主义学科的教学和研究。

国学院 ：研究中国传统文化，特别是中医药文化。

国际学院 ：包含台港澳中医学部，提供国际化教育。

继续教育学部 ：提供成人教育和继续教育。

体育教学部 ：负责体育教学和活动。

制药工程系 ：提供制药工程相关专业。

康复治疗学系 ：提供康复治疗学相关专业。

公共事业管理系 ：提供公共事业管理相关专业。

这些院系和专业构成了北京中医药大学的教育体系，旨在培养高素质的中医药人才，推动中医药学科的发展和国际化。