爱沙尼亚拥有多所知名大学，以下是一些主要的大学：

塔尔图大学 （University of Tartu） ：

成立于1632年，是爱沙尼亚最古老和规模最大的大学，也是北欧乃至全欧洲最古老的大学之一。

在多个学科领域都有卓越的表现，包括神学、法律、医学、哲学、生物和地理、物理和化学、教育、体育、经商管理、数学和信息科学、社会学等。

塔林理工大学 （Tallinn University of Technology） ：

始建于1918年，是塔林最古老和规模最大的大学，同时也是爱沙尼亚最大的国立理工类大学。

塔林大学 （Tallinn University） ：

由塔林市的多所知名大学和学院合并成立，是一所综合性大学。

爱沙尼亚生命科学大学 （Estonian University of Life Sciences） ：

位于塔尔图市，专注于自然资源可持续发展、遗产及栖息地环境保护，是该国农业、林业、畜牧业、兽医学、城乡生活和经济、食品科学和环保技术的研究发展中心。

爱沙尼亚商学院 （Estonian Business School） ：

提供商业教育和管理培训。

爱沙尼亚音乐与戏剧学院 （Estonian Academy of Music and Theatre） ：

培养音乐和戏剧方面的人才。

诺德大学 （University Nord） ：

成立于1991年，是爱沙尼亚成立最早、最著名的私立大学之一，提供现代化的新型教育课程。

这些大学在各自的领域内都有显著的学术成就和国际影响力。塔尔图大学作为爱沙尼亚的学术中心，拥有丰富的学科研究和世界级的科研成果。塔林理工大学则专注于理工科教育，而塔林大学则是一所综合性大学，提供多样化的学术资源和国际合作机会。爱沙尼亚生命科学大学和商学院则分别在农业、林业、畜牧业、兽医学和商业管理等领域提供专业的教育和培训。