巴伐利亚州拥有众多高等教育机构，其中包括综合性大学、高等专科学校、应用技术大学、音乐学院等。以下是一些著名的巴伐利亚州学校：

综合性大学 ：

奥格斯堡大学 （Universität Augsburg）

班堡大学 （Otto-Friedrich-Universität Bamberg）

拜罗伊特大学 （Universität Bayreuth）

埃尔朗根-纽伦堡大学 （Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg）

慕尼黑大学 （Ludwig-Maximilians-Universität München）

慕尼黑工业大学 （Technische Universität München）

帕绍大学 （Universität Passau）

雷根斯堡大学 （Universität Regensburg）

维尔茨堡大学 （Julius-Maximilians-Universität Würzburg）

高等专科学校 ：

慕尼黑联邦国防军大学 （Universität der Bundeswehr München）

德国艾希施泰特天主教大学 （Katholische Universität Eichstätt-Ingolstadt）

德国巴伐利亚州新教教堂音乐学院 （Augustana - Theologische Hochschule der Evangelisch-Lutherischen Kirche in Bayern）

其他教育机构 ：

纽伦堡技术大学 （Technische Universität München）：计划在纽伦堡南部建设一所全新的精英大学，总投资12亿欧元，将在2025年开放，计划以美国教学的方式培养工程人才。

巴伐利亚州大学联盟/巴伐利亚州对华高教中心 （Bayerisches Hochschulzentrum für China）：成立于2007年，设立于德国拜罗伊特大学，面向所有巴伐利亚州公立大学的非盈利服务性机构。

这些学校涵盖了从本科到研究生各个层次的教育，并且都有其独特的专业和研究方向。巴伐利亚州的教育体系在德语区享有很高的声誉，其高等教育机构在全球范围内也具有竞争力。