高考分数比估分低的原因主要有以下几点：

答题卡涂写问题 ：

涂答题卡不够深，导致答案无法被电脑准确读取。现在高考答题卡需要使用2B铅笔涂黑涂满，如果涂得不够深，或者使用了假的2B铅笔，都可能导致电脑阅答题卡时看不清晰或不能准确评判，从而影响成绩。

评分标准和方法不同 ：

高考评分标准严格，评分人员必须严格按照国家规定的标准进行评分，而平时测试的评分标准相对较宽松，评分人员往往会根据自己的主观感受进行评分，容易出现得分偏高或偏低的情况。

高考评分采用全国统一的人工阅卷方式，评分人员需要认真查阅答卷，一题一题地打分，而平时测试往往采用自动化评分方式，评分过程迅速而简便，容易出现评分偏差。

考试时间限制 ：

高考时间有限，有些考生在答题时可能因为时间不够而未能充分思考或涂写答案，导致实际得分低于预期。

心理因素 ：

高考是一个重要考试，学生考前的紧张和考试时的心理压力可能会影响他们的发挥，导致成绩不如预期。

估分不准确 ：

有些考生在估分时可能过于乐观，没有仔细对照标准答案，导致估分过高。特别是成绩中等或平时不太严谨的考生，在对照标准答案时可能估分不准确。

其他因素 ：

卷面污损、字迹不清、使用不耐高温的笔等问题也会影响评分结果，而这些因素在平时测试中较为少见。

综上所述，高考分数比估分低的原因是多方面的，包括答题卡涂写问题、评分标准和方法的不同、考试时间限制、心理因素、估分不准确以及其他一些特殊情况。因此，考生在高考后估分时应该尽量仔细对照标准答案，避免因为以上原因导致估分不准确。