济宁高考之所以安排在早上9:00开始并在下午5:00结束，主要是基于以下几个原因：

时间安排合理：

这样的时间安排可以确保考生有充足的时间完成所有科目的考试，同时留出足够的时间进行阅卷和志愿填报。早上9:00开始可以避免考生因前一日休息不足而影响第二天的考试状态，下午5:00结束则给阅卷和录取工作留下了充分的时间。

科目安排：

高考通常包括语文、数学、外语以及文科或理科综合等科目。这些科目内容较多，如果集中在一天内完成，考生需要连续考试数个小时，容易疲劳和出现失误，影响考试成绩。因此，将考试分成两天进行，不仅能够保证考试的公正性和准确性，还能够保护考生的身心健康。

公平公正：

高考作为国家级考试，其公平性和公正性至关重要。将考试安排在一天内完成，可以确保所有考生都在相同的时间段内参加考试，避免了因时间不一致而产生的不公平因素。

健康和安全：

高考期间，保障师生的健康和安全是首要任务。早上9:00开始，考生可以避免在高温天气下长时间考试，有利于保持体力和精神状态。此外，这样的时间安排也有助于减少疫情等突发状况对考试的影响，确保考试的顺利进行。

综上所述，济宁高考在早上9:00开始并在下午5:00结束，是为了确保考生有充足的时间完成考试，保证考试的公正性和准确性，同时兼顾师生的健康和安全。