高考考日语的限制主要包括以下几点：

特殊院校和专业限制

军事、国防和公共安全等部分特殊院校（专业）：这些院校及专业可能会对日语考生有特定的录取限制。例如，国防科技大学、陆军军医大学、海军军医大学和空军军医大学等相关限制为“考生入校后外语教学为英语”、“考生入校后均以英语为公共外语教学内容安排教学”等类似表述。

外国语言文学类专业：部分外国语言文学类专业可能会有相关的录取限制。

高校自主限制

尽管大部分高校不得对报考非外国语言文学类专业的考生作统考外语语种限制，但仍有部分高校可能会根据自身情况对日语考生作出额外限制。具体情况需查阅相关高校的招生简章。

专业要求

一些专业如计算机、软件、翻译、对外经贸等，部分大学可能会对日语考生有特定的限制。

学位授予

用日语参加高考对获得毕业证书和学位没有影响，大部分高校的学士学位授予已与大学英语四级通过与否脱钩，对于极少数还需要四六级合格才能获得学位证的高校，也可以用日语等级证书或者日语四级代替。

综上所述，高考考日语的主要限制集中在特殊院校和专业以及部分高校自主限制上，大部分高校和专业对日语考生没有限制。建议考生在选择日语作为高考外语时，仔细查阅相关高校的招生简章和专业要求，以确保顺利报考。