在南昌市，有几所高中在高考成绩方面表现非常出色，可以认为它们是南昌市最好的高中：

江西师范大学附属中学：

这所学校是江西省首批省级重点中学，也是全国奥林匹克教育示范学校。江西师范大学附属中学在历年高考中表现优异，多次获得全省文理科前10强的好成绩。2020年高考中，该校文科最高分665分，列全省第二；理科最高分697分、696分列全省理科前10强，600分上线人数占比57.55%，一本上线率91.64%。

南昌二中：

南昌二中是江西省首批示范普通高中，也是省级教育系统先进集体成员。该校在2020年高考中600分以上学子合计505人，一本上线率81.44%，二本上线率98.38%。

江科附中：

江科附中也是南昌市重点高中的第一方阵，虽然具体成绩未详细列出，但其在高考中的表现也较为突出。

南昌市第三中学：

这所学校是省、市优秀重点中学，2020年高考中600分以上学子合计114人，一本上线率53.69%，二本上线率80.63%。

莲塘一中：

由于地理优势，莲塘一中近年来成绩逐年提升，挤进了南昌市前几名。

综合以上信息，可以得出结论：在南昌市， 江西师范大学附属中学、 南昌二中和 江科附中是高考成绩最好的三所高中。它们在历年高考中均表现出色，一本上线率和600分上线人数比例均位居前列。建议家长和学生在选择高中时，可以优先考虑这几所学校。