普宁市有以下学校有学生考入清华大学和北京大学：

普宁第二中学

普宁第二中学是揭阳市最好的中学之一，平均每年都有几个考上清华北大，上一批线的学生占据绝大多数，本科率在八十以上。全国的名校如清华、北大、浙大、中大、复旦等，省内的名校如华师、华理、广外、暨南、汕大等，二中的学生都有机会考入。

普宁新世界中英文学校

普宁新世界中英文学校参加高考以来，有1人获广东省状元，6人获揭阳市状元，13人考入清华大学、北京大学，368人考入985、211全国著名大学。该校的一本录取率和本科录取率在揭阳市名列前茅，升学率年年位居揭阳市第一。

普宁勤建学校

普宁勤建学校迎来清华大学生源学校揭牌仪式，2022年广东高考潮汕各校清北录取情况排行榜中，普宁勤建学校有学生考入清华大学。

普宁二中实验学校

2022年高校专项计划报名审核通过的考生名单中，普宁二中实验学校的吴境通过北京大学、清华大学高校专项计划报名审核。

综上所述，普宁市有以下学校有学生考入清华大学和北京大学：

1. 普宁第二中学

2. 普宁新世界中英文学校

3. 普宁勤建学校

4. 普宁二中实验学校

建议家长和学生在选择学校时，可以综合考虑学校的教学质量、历年高考成绩、学校设施、师资力量等多方面因素，选择最适合自己的学校。